34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1424 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1424  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 92 aa  186  9e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.183922  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1288  CRISPR-associated protein Cas2  85.87 
 
 		 92 aa  163  8e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.566019  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.05 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.22 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  40.91 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.91 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0618  CRISPR-associated protein Cas2  35.63 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  39.78 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  40 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.53 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  38.3 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  37.23 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.36 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  38.64 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  35.16 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.48 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.97 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  31.82 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.83 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  29.07 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  27.78 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.13 
 
 		 87 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  35.9 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.41 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  32.18 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.46 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  31.18 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  33.77 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.21 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.09 
 
 		 91 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.17 
 
 		 96 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  30 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  30.14 
 
 		 96 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>