69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1018 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 
87 aa  176  8e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.67 
 
 
87 aa  82.8  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  45.68 
 
 
87 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.13 
 
 
87 aa  80.1  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  43.02 
 
 
87 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.53 
 
 
87 aa  79.3  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  44.19 
 
 
87 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  48.28 
 
 
87 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.53 
 
 
87 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.83 
 
 
87 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  44.19 
 
 
87 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  44.19 
 
 
87 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  41.38 
 
 
87 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.37 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  43.75 
 
 
87 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.44 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0618  CRISPR-associated protein Cas2  44.83 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  50.79 
 
 
87 aa  68.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.53 
 
 
87 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  37.93 
 
 
87 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.56 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.63 
 
 
87 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.78 
 
 
87 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.12 
 
 
86 aa  65.1  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  43.02 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.98 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.21 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.93 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  37.35 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  42.5 
 
 
86 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  45 
 
 
86 aa  61.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  37.65 
 
 
88 aa  60.5  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.05 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.73 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  36.36 
 
 
90 aa  58.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1396  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.18 
 
 
92 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1448  CRISPR-associated protein Cas2  37.93 
 
 
87 aa  55.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  31.82 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3326  CRISPR-associated protein Cas2  44.93 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  38.16 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  45 
 
 
95 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2839  CRISPR-associated protein Cas2  33.75 
 
 
87 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.230646  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.46 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1424  CRISPR-associated protein Cas2  31.82 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.183922  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  29.07 
 
 
96 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2002  CRISPR-associated protein Cas2  35.29 
 
 
71 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  39.13 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  28.4 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0904  CRISPR-associated protein Cas2  31.18 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216718  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  31.71 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  30.23 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1288  CRISPR-associated protein Cas2  30.23 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.566019  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.21 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  28.24 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  28.24 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  29.41 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  31.4 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  26.14 
 
 
96 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  31.82 
 
 
96 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.81 
 
 
89 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  29.87 
 
 
94 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0393  CRISPR-associated protein Cas2  33.75 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0694049  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  31.76 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.33 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.38 
 
 
95 aa  40  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  26.25 
 
 
93 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>