70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1231 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 
94 aa  190  5e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  59.14 
 
 
92 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  50.59 
 
 
87 aa  85.5  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  40.22 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.36 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  34.25 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.59 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  36.59 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  34.15 
 
 
87 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  35.11 
 
 
87 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  30.11 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.07 
 
 
87 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  38.36 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.02 
 
 
87 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.02 
 
 
87 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.17 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.08 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  37.23 
 
 
86 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  36.67 
 
 
94 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  38.46 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  35.37 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  34.62 
 
 
87 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.86 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  41.54 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  30.53 
 
 
96 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  36.92 
 
 
97 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  35.37 
 
 
87 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  35.38 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.91 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  36.25 
 
 
87 aa  50.8  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  40 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  31.71 
 
 
87 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  40 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.94 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  33.85 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.15 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  32.89 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  35 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.85 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0904  CRISPR-associated protein Cas2  34.15 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216718  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  33.85 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.85 
 
 
96 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  32.89 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1448  CRISPR-associated protein Cas2  32.1 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.37 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0666  CRISPR-associated protein Cas2  35.71 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.29 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  30.77 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  35.38 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.99 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.92 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  34.15 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.92 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0618  CRISPR-associated protein Cas2  34.15 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  35.29 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  32.86 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  35.29 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  35.38 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.48 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.23 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0393  CRISPR-associated protein Cas2  32.84 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0694049  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  30.77 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  29.33 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  33.85 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  35.38 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1276  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.79 
 
 
91 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  29.87 
 
 
87 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>