81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2972 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 96 aa  202  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  73.96 
 
 		 95 aa  154  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  68.75 
 
 		 96 aa  147  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  66.67 
 
 		 96 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  66.67 
 
 		 96 aa  144  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  67.71 
 
 		 96 aa  143  8.000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  63.54 
 
 		 96 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  66.67 
 
 		 96 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  62.5 
 
 		 96 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  59.38 
 
 		 96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  56.25 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  63.16 
 
 		 95 aa  128  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  59.38 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  55.21 
 
 		 99 aa  123  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  59.38 
 
 		 96 aa  123  9e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  57.29 
 
 		 99 aa  123  9e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  54.17 
 
 		 99 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  58.33 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1728  CRISPR-associated Cas2 family protein  55.21 
 
 		 96 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31570  CRISPR-associated protein Cas2  69.79 
 
 		 95 aa  115  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1634  CRISPR-associated protein Cas2  64.58 
 
 		 96 aa  114  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  58.89 
 
 		 97 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  46.88 
 
 		 96 aa  98.6  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2357  CRISPR-associated Cas2 family protein  50 
 
 		 94 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  48.96 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  43.75 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.75 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3908  hypothetical protein  53.61 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  41.94 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  51.04 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  42.55 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  40.43 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  42.11 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  46.39 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  40.48 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  35.42 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  42.7 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  39.33 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.3 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  41.38 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.25 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.51 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2991  hypothetical protein  58.97 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  36.05 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  31.96 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  30.93 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  32.99 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  31.11 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  32.91 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.96 
 
 		 94 aa  50.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.94 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  32.95 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  32.94 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.21 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  32.94 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  34.78 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  30 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.85 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.21 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  27.96 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.21 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  28.89 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  31.46 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  31.46 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.47 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  34.38 
 
 		 95 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  30.77 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.56 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  36.76 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.78 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  26.04 
 
 		 115 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  27.78 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 93 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  32.18 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.56 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.34 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.74 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  36.36 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.39 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0620  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.82 
 
 		 104 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0662433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>