65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2840 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 93 aa  184  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  40.66 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.16 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.86 
 
 		 89 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  31.33 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.18 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  37.8 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.7 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  39.06 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_002950  PG1981  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.43 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.25 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.59 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  35.63 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  32.58 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.05 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  36.78 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.47 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  35.37 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  37.18 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.04 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.63 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2912  CRISPR-associated protein Cas2  38.46 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  36.71 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  32.98 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  31.17 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  30.34 
 
 		 91 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  42.19 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  34.48 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1440  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122416  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  39.44 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  32.98 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.71 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.25 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.47 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  29.21 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  30.34 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  39.08 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  34.04 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  31.82 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.94 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.11 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.38 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.57 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.24 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0620  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.26 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0662433  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  35.48 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  34.48 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  32.56 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  31.03 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.58 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  38.89 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.27 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  32.18 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.53 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  34.67 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  36.92 
 
 		 93 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1728  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.4 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0622  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.25 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15209  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  32.29 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0115  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.16 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0035101  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>