77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1985 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 93 aa  186  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  60.87 
 
 		 93 aa  119  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  55.43 
 
 		 93 aa  112  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  40.91 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.43 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  47.31 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.34 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  40.96 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  48.19 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  46.25 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.94 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.44 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.16 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.44 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.31 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  40.7 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3579  CRISPR-associated protein Cas2  37.93 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  38.3 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  41.56 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  41.25 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0971  hypothetical protein  44.62 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000196536  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0225  CRISPR-associated protein Cas2  71.05 
 
 		 54 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.724313 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  43.53 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  47.83 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  46.58 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12830  hypothetical protein  40.74 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000022807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  33.7 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  35.63 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  40.66 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  38.14 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  38.14 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  35.37 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.63 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  36.36 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.85 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.56 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  40.91 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  38.71 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  40.28 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.9 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  34.09 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  36.99 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.58 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  34.52 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0137603 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2292  CRISPR-associated protein Cas2  39.66 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.15 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  31.82 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  44.07 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1857  hypothetical protein  36.25 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.224692  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  35.23 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  38.24 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1981  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.52 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.16 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  32.95 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.82 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.82 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  35.63 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1122  CRISPR-associated Cas2 family protein  48.15 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00381279  normal  0.727583 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1440  CRISPR-associated protein Cas2  39.66 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122416  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  39.66 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3908  hypothetical protein  34.67 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  38.89 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.73 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  35.63 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  36.11 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 96 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.5 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1448  CRISPR-associated protein Cas2  36.14 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.62 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.58 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1149  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.57 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3304  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.07 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.63909 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1276  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.46 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  31.11 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>