77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0709 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 
91 aa  186  7e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0225  CRISPR-associated protein Cas2  86.67 
 
 
54 aa  88.2  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.724313 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  45.88 
 
 
92 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.23 
 
 
92 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  41.56 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.25 
 
 
93 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  41.25 
 
 
91 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  41.56 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  43.94 
 
 
94 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.7 
 
 
89 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 
91 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.63 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.25 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.49 
 
 
94 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  36.84 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  41.3 
 
 
99 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  41.43 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  40.22 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  41.25 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  38.67 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  37.89 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  38.24 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  40.3 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  37.63 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  39.74 
 
 
94 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.03 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.46 
 
 
92 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  36.46 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.57 
 
 
124 aa  55.1  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  38.81 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  42.42 
 
 
94 aa  55.1  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.25 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.56 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.04 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.71 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12830  hypothetical protein  35.23 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000022807  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  42.47 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  38.57 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.14 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  36.96 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.24 
 
 
96 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.7 
 
 
106 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  38.24 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  41.18 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  35.87 
 
 
96 aa  50.4  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  37.65 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  33.8 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  40.85 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  34.12 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  37.5 
 
 
97 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1149  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.25 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399869  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  38.04 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.88 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3908  hypothetical protein  44.23 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48914  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  36.62 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0622  CRISPR-associated Cas2 family protein  25.84 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15209  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  32.61 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  33.78 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.78 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2292  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.57 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0058  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.35 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  31.52 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  37.68 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  37.31 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1634  CRISPR-associated protein Cas2  38.33 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.84 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.5 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1440  CRISPR-associated protein Cas2  36.92 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122416  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0620  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.1 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0662433  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.18 
 
 
96 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  28.57 
 
 
94 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.48 
 
 
92 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1276  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.38 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  35.38 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1122  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.85 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00381279  normal  0.727583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>