36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1149 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1149  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 86 aa  176  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399869  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2292  CRISPR-associated protein Cas2  63.1 
 
 		 88 aa  120  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2281  CRISPR-associated protein Cas2  36.67 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.71 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15200  CRISPR-associated protein Cas2  28.75 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1075  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.86 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0566  CRISPR-associated protein Cas2  32.1 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.527925  normal  0.236066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6021  CRISPR-associated protein Cas2  28.75 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.088486  normal  0.298302 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1141  CRISPR-associated Cas2 family protein  40 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.210554  hitchhiker  0.00000272687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.33 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  30 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0773  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.88 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.294628  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3304  CRISPR-associated Cas2 family protein  30 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.63909 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1122  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.74 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00381279  normal  0.727583 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  38.33 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0115  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.1 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0035101  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1766  CRISPR-associated protein Cas2  32.39 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.36 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1276  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.18 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.92 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0577  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.17 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0715298  normal  0.0619602 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5082  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.08 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1871  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.14 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  32.5 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.21 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  28.57 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  35.59 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  35 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  35.48 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  31.25 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.68 
 
 		 92 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.57 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12830  hypothetical protein  43.14 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000022807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  40.43 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.86 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  34.15 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>