22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1871 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1871  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 84 aa  176  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3304  CRISPR-associated Cas2 family protein  90.36 
 
 		 85 aa  162  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.63909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0566  CRISPR-associated protein Cas2  67.5 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.527925  normal  0.236066 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5082  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.16 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1766  CRISPR-associated protein Cas2  44.05 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1288  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.71 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1075  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.62 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.57 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0773  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.86 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.294628  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1276  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.28 
 
 		 91 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1122  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.8 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00381279  normal  0.727583 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1141  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.92 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.210554  hitchhiker  0.00000272687 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1149  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.14 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  30.95 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2292  CRISPR-associated protein Cas2  38.46 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15200  CRISPR-associated protein Cas2  33.82 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2281  CRISPR-associated protein Cas2  40.43 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0115  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.75 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0035101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.88 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.4 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6021  CRISPR-associated protein Cas2  29.23 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.088486  normal  0.298302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>