24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6021 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6021  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.088486  normal  0.298302 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  53.12 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0773  CRISPR-associated Cas2 family protein  53.12 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.294628  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  52.08 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15200  CRISPR-associated protein Cas2  47.37 
 
 		 96 aa  99.4  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.83 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1075  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.95 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0115  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.74 
 
 		 96 aa  72  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0035101  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1288  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.36 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1149  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.75 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1766  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2292  CRISPR-associated protein Cas2  31.17 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.57 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.71 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0734  hypothetical protein  26.25 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0419204  normal  0.160516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0566  CRISPR-associated protein Cas2  27.85 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.527925  normal  0.236066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3304  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.51 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.63909 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5082  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.16 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.86 
 
 		 92 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.93 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1871  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.23 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2281  CRISPR-associated protein Cas2  24.14 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0577  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.5 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0715298  normal  0.0619602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.38 
 
 		 91 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>