39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0773 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0773  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 96 aa  190  4e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.294628  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  90.62 
 
 		 96 aa  178  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  67.71 
 
 		 96 aa  136  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  58.33 
 
 		 95 aa  114  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6021  CRISPR-associated protein Cas2  53.12 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.088486  normal  0.298302 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15200  CRISPR-associated protein Cas2  52.63 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0115  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.32 
 
 		 96 aa  91.3  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0035101  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1075  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.44 
 
 		 97 aa  87.8  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1276  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.29 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  38.96 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3304  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.76 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.63909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1871  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.86 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2292  CRISPR-associated protein Cas2  29.89 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1766  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1149  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.88 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1288  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.99 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.24 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.24 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.1 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5082  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.51 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0566  CRISPR-associated protein Cas2  48.72 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.527925  normal  0.236066 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1122  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.59 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00381279  normal  0.727583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.68 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  36.36 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  33.7 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.1 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1141  CRISPR-associated Cas2 family protein  28 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.210554  hitchhiker  0.00000272687 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.5 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.76 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  32.14 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.18 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0577  CRISPR-associated Cas2 family protein  26.25 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0715298  normal  0.0619602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.52 
 
 		 106 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  32.14 
 
 		 96 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.94 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  36.25 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.91 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.06 
 
 		 87 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>