102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1008 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 106 aa  222  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  73.96 
 
 		 96 aa  159  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  71.88 
 
 		 96 aa  155  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  68.75 
 
 		 99 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  64.58 
 
 		 99 aa  140  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  61.46 
 
 		 96 aa  131  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  60.42 
 
 		 96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  56.25 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  59.38 
 
 		 96 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  59.38 
 
 		 96 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  59.38 
 
 		 96 aa  124  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  56.25 
 
 		 99 aa  124  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  58.95 
 
 		 95 aa  124  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  54.17 
 
 		 96 aa  120  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  53.12 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  57.29 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1728  CRISPR-associated Cas2 family protein  54.74 
 
 		 96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  58.33 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  54.17 
 
 		 96 aa  117  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  54.44 
 
 		 97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  51.04 
 
 		 96 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31570  CRISPR-associated protein Cas2  58.33 
 
 		 95 aa  106  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2357  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.74 
 
 		 94 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  97.1  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.92 
 
 		 96 aa  93.6  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1634  CRISPR-associated protein Cas2  52.08 
 
 		 96 aa  92  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  43.75 
 
 		 96 aa  87.4  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.83 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  42.55 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  43.62 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  50.72 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  42.55 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  42.86 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3908  hypothetical protein  47.42 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48914  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  43.3 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  32.99 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  34.83 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.21 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  32.94 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2991  hypothetical protein  44.23 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  35.23 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.44 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.38 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  43.08 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.58 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  35.14 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.35 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.85 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  34.04 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.02 
 
 		 93 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.2 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  31.96 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  31.96 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  36.9 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.38 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  27.08 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  37.84 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.85 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.13 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.58 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  36.23 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.99 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.72 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.68 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.23 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.14 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0666  CRISPR-associated protein Cas2  33.8 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.58 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  31.31 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  38.03 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  32.14 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  35.62 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  38.24 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  36.36 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  28.3 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.36 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  32.53 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  34.85 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  36.23 
 
 		 87 aa  43.5  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.68 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2912  CRISPR-associated protein Cas2  30.77 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0904  CRISPR-associated protein Cas2  31.51 
 
 		 103 aa  42.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216718  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  35.9 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.07 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  33.77 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0058  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.47 
 
 		 95 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0773  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.52 
 
 		 96 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.294628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 		 87 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.41 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.91 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.58 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.5 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  36.23 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  25.56 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.21 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0393  CRISPR-associated protein Cas2  28.17 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0694049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>