36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2912 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013502  Rmar_2912  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 96 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1440  CRISPR-associated protein Cas2  39.78 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0058  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.42 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  44.62 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  37.8 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0620  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.86 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0662433  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.23 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  35.38 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  40.62 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.76 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  36 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  38.46 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  32 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0622  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.26 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15209  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  30 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.9 
 
 		 94 aa  48.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  32 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.83 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  43.48 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  35.48 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  31.33 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  34.48 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  35 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  30 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.67 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.15 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.24 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.77 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.75 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  34.72 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  34.33 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.15 
 
 		 124 aa  42  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  32.31 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  30 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.36 
 
 		 92 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>