63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1652 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 92 aa  179  8.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1396  CRISPR-associated Cas2 family protein  49.43 
 
 		 92 aa  88.2  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.3 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.04 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  41.77 
 
 		 87 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.77 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.97 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.51 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.04 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  48.1 
 
 		 87 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  40.51 
 
 		 87 aa  72  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  39.24 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  44.3 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  38.64 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  39.24 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.24 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  36.71 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  41.38 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.79 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.24 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  34.57 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.77 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.78 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.51 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  36.05 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.18 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0618  CRISPR-associated protein Cas2  40.51 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  37.35 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  46.77 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  31.03 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  40.3 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2002  CRISPR-associated protein Cas2  40.62 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.78 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.43 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.84 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  33.87 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.38 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  33.7 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  40 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  34.48 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  38.98 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.57 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  31.52 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.36 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1448  CRISPR-associated protein Cas2  28.74 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  47.5 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  36.76 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1424  CRISPR-associated protein Cas2  29.41 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.183922  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.35 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0904  CRISPR-associated protein Cas2  33.7 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216718  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  26.09 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.11 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2912  CRISPR-associated protein Cas2  31.75 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0393  CRISPR-associated protein Cas2  32.88 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0694049  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  38.03 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  32.31 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  32.35 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0666  CRISPR-associated protein Cas2  32.88 
 
 		 99 aa  41.2  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  37.31 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.62 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  30.95 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>