54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0938 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 
87 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  67.82 
 
 
87 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  63.22 
 
 
87 aa  123  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.71 
 
 
87 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.68 
 
 
87 aa  82  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  40.23 
 
 
87 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  39.08 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  39.08 
 
 
87 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  40.23 
 
 
87 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  42.86 
 
 
87 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.78 
 
 
87 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  40.7 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.26 
 
 
87 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 
87 aa  67.8  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  41.56 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  37.93 
 
 
87 aa  67  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  42.86 
 
 
87 aa  67  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.2 
 
 
87 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.66 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.37 
 
 
87 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.66 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.74 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.04 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.36 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  38.37 
 
 
88 aa  61.6  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  35.06 
 
 
87 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.16 
 
 
89 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0618  CRISPR-associated protein Cas2  39.08 
 
 
87 aa  60.8  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  31.82 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.91 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  29.55 
 
 
92 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  29.07 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.07 
 
 
91 aa  52  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  26.92 
 
 
94 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1448  CRISPR-associated protein Cas2  32.05 
 
 
87 aa  51.6  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  31.71 
 
 
94 aa  50.4  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1396  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.87 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.46 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  29.87 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  30.77 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2002  CRISPR-associated protein Cas2  32.26 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0904  CRISPR-associated protein Cas2  27.96 
 
 
103 aa  47  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216718  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.14 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  31.4 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.4 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0393  CRISPR-associated protein Cas2  29.33 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0694049  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.37 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0666  CRISPR-associated protein Cas2  29.23 
 
 
99 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.4 
 
 
91 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3326  CRISPR-associated protein Cas2  32.56 
 
 
86 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  33.82 
 
 
97 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>