83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0542 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 87 aa  174  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  72.41 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  70.11 
 
 		 87 aa  124  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  68.6 
 
 		 87 aa  122  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  64.37 
 
 		 87 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  62.07 
 
 		 87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  64.37 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  63.41 
 
 		 87 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  63.22 
 
 		 86 aa  107  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  59.77 
 
 		 87 aa  107  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  57.83 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  57.83 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  57.14 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0618  CRISPR-associated protein Cas2  58.62 
 
 		 87 aa  95.9  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  52.87 
 
 		 87 aa  95.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  50.62 
 
 		 87 aa  90.5  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  48.84 
 
 		 91 aa  88.6  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  53.09 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  49.43 
 
 		 87 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  44.19 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  51.72 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  57.65 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  45.98 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  43.68 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.58 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.68 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  42.53 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.23 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.24 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  40.26 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.7 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  36.96 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  42.05 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  41.98 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.63 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.86 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1448  CRISPR-associated protein Cas2  39.08 
 
 		 87 aa  62  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  43.42 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  39.47 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  34.07 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1396  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.93 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2002  CRISPR-associated protein Cas2  44.62 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1424  CRISPR-associated protein Cas2  40 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.183922  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0904  CRISPR-associated protein Cas2  38.71 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216718  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  39.02 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  34.48 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1288  CRISPR-associated protein Cas2  38.89 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.566019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  38.54 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  31.11 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  29.55 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.38 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.03 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2839  CRISPR-associated protein Cas2  35.71 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.230646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  35.23 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  35.71 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0393  CRISPR-associated protein Cas2  34.85 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0694049  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.89 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0666  CRISPR-associated protein Cas2  37.74 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  34.78 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  33.8 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.94 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  36.62 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  31.4 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  32.93 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  30.56 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  31.65 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.21 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  28.09 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  31.03 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.47 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.34 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  28.42 
 
 		 96 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  35.82 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  29.47 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  30.49 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0773  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.94 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.294628  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  28.42 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.38 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.76 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>