62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0304 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  62.07 
 
 
87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  45.68 
 
 
87 aa  81.3  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  45.35 
 
 
87 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  42.53 
 
 
87 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.74 
 
 
87 aa  79.7  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.98 
 
 
87 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.35 
 
 
87 aa  77.8  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  44.44 
 
 
87 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  46.91 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.91 
 
 
87 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.91 
 
 
87 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  43.21 
 
 
87 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  44.83 
 
 
86 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  42.53 
 
 
87 aa  72  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.68 
 
 
87 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  43.75 
 
 
88 aa  70.1  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  46.84 
 
 
87 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.3 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.53 
 
 
87 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0618  CRISPR-associated protein Cas2  43.68 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.24 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  50.79 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.37 
 
 
91 aa  63.5  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.75 
 
 
87 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  35.06 
 
 
87 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.93 
 
 
93 aa  61.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.84 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1448  CRISPR-associated protein Cas2  43.66 
 
 
87 aa  58.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.48 
 
 
87 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.78 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.9 
 
 
87 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  36.25 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.35 
 
 
92 aa  57.8  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  35.11 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.44 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  45.31 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  32.56 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  29.35 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  33.72 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2839  CRISPR-associated protein Cas2  39.34 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.230646  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1396  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.78 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  39.29 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3326  CRISPR-associated protein Cas2  39.34 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2002  CRISPR-associated protein Cas2  42.86 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.33 
 
 
92 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  32.39 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.54 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0904  CRISPR-associated protein Cas2  31.52 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216718  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.46 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1424  CRISPR-associated protein Cas2  33.77 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.183922  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  31 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.9 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  29.76 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0666  CRISPR-associated protein Cas2  36.36 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  31.91 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.8 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.07 
 
 
94 aa  40.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  35 
 
 
92 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.29646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>