51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0904 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0904  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 
103 aa  208  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216718  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  57.43 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0393  CRISPR-associated protein Cas2  54.64 
 
 
97 aa  108  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0694049  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0666  CRISPR-associated protein Cas2  55.81 
 
 
99 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  52.58 
 
 
94 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  40.86 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.37 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  40.86 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.71 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  38.27 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.56 
 
 
87 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  38.55 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  33.71 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.11 
 
 
87 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  34.44 
 
 
86 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.04 
 
 
87 aa  51.6  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  36.56 
 
 
87 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  30 
 
 
87 aa  50.4  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  36.56 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  38.71 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.64 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.94 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.94 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  34.15 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  40 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.49 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  27.96 
 
 
87 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  32.95 
 
 
87 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  27.84 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.76 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.71 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.11 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  31.18 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  32.39 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  31.52 
 
 
87 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  32.22 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.51 
 
 
106 aa  42.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.12 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.58 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.7 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  34.92 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.14 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  30.16 
 
 
96 aa  41.2  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  24.47 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.57 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.16 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  32.61 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  39.73 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>