78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2296 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 87 aa  177  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  63.22 
 
 		 87 aa  114  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  62.07 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  64.94 
 
 		 87 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  57.47 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  61.04 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  58.44 
 
 		 87 aa  96.7  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  57.14 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  58.44 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  57.14 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  51.16 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  57.14 
 
 		 87 aa  91.7  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0618  CRISPR-associated protein Cas2  58.44 
 
 		 87 aa  89.7  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  49.43 
 
 		 87 aa  88.6  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.83 
 
 		 87 aa  86.3  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  58.44 
 
 		 87 aa  86.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  50.57 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  53.16 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  44.71 
 
 		 87 aa  85.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.98 
 
 		 87 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  51.32 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.83 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.35 
 
 		 86 aa  80.1  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  59.74 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.78 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.23 
 
 		 87 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.19 
 
 		 87 aa  73.9  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  44.16 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.24 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  43.68 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  41.38 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.79 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  44.32 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  41.56 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.26 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  39.56 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1424  CRISPR-associated protein Cas2  42.22 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.183922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  34.48 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1288  CRISPR-associated protein Cas2  38.82 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.566019  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  33.71 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  36.17 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  34.62 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1448  CRISPR-associated protein Cas2  40.7 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  31.82 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1396  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0393  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0694049  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0904  CRISPR-associated protein Cas2  34.94 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216718  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  37.35 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3326  CRISPR-associated protein Cas2  29.76 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0666  CRISPR-associated protein Cas2  41.51 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2839  CRISPR-associated protein Cas2  38.81 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.230646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2002  CRISPR-associated protein Cas2  36.84 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  32.58 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0115  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.33 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0035101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.77 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.68 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  34.94 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.77 
 
 		 91 aa  42.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.34 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.62 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.07 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.03 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  34.78 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.78 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  32.05 
 
 		 92 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  30.99 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  29.21 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.58 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  32.35 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  37.68 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>