44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1396 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1396  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 92 aa  187  5.999999999999999e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  49.43 
 
 		 92 aa  88.2  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.75 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.51 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.27 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  41.46 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  40 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  40.24 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.68 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  40.51 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.02 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  38.75 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.93 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.55 
 
 		 91 aa  57  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.93 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  41.18 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.97 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.93 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3579  CRISPR-associated protein Cas2  32.61 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  34.48 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.44 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  30 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  38.37 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  36.78 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0618  CRISPR-associated protein Cas2  35.37 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1448  CRISPR-associated protein Cas2  35.44 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  31.82 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  33.77 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  38.75 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.11 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  34.67 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.5 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.58 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2839  CRISPR-associated protein Cas2  32 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.230646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  33.77 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  30.99 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  28.57 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.14 
 
 		 94 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>