45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1560 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 88 aa  178  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1857  hypothetical protein  55.68 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.224692  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3579  CRISPR-associated protein Cas2  44.44 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  37.8 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  37.8 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.46 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.12 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  34.83 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  37.8 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  42.25 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  35.96 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  39.51 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.71 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.04 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  36.78 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.63 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.38 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.87 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  32.58 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  34.09 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  32.58 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.9 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0734  hypothetical protein  32.93 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0419204  normal  0.160516 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1075  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.1 
 
 		 97 aa  47.8  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.09 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.09 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  40.51 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  32.63 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.87 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0058  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.87 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  36.62 
 
 		 99 aa  42.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1766  CRISPR-associated protein Cas2  32.5 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  35.53 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1396  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.58 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12830  hypothetical protein  36.36 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000022807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  37.65 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  28.41 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1981  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.8 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.87 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  32.18 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.23 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  32.86 
 
 		 97 aa  40  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  30.68 
 
 		 96 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>