27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1075 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1075  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 
97 aa  192  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.78 
 
 
96 aa  91.7  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15200  CRISPR-associated protein Cas2  41.24 
 
 
96 aa  88.2  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.57 
 
 
95 aa  88.6  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0773  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.44 
 
 
96 aa  87.8  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.294628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.22 
 
 
96 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6021  CRISPR-associated protein Cas2  38.95 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.088486  normal  0.298302 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0115  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.33 
 
 
96 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0035101  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1766  CRISPR-associated protein Cas2  41.46 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1871  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.62 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0566  CRISPR-associated protein Cas2  34.57 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.527925  normal  0.236066 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1276  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.94 
 
 
91 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1149  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.86 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399869  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1288  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.71 
 
 
106 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3304  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.5 
 
 
85 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.63909 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5082  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.21 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2292  CRISPR-associated protein Cas2  34.15 
 
 
88 aa  48.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0734  hypothetical protein  35.37 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0419204  normal  0.160516 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.1 
 
 
88 aa  47.8  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2281  CRISPR-associated protein Cas2  34.12 
 
 
99 aa  47.4  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1141  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.67 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.210554  hitchhiker  0.00000272687 
 
 
-
 
NC_002950  PG1981  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.1 
 
 
96 aa  47.4  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0162  hypothetical protein  36.47 
 
 
99 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1122  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.44 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00381279  normal  0.727583 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0577  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.05 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0715298  normal  0.0619602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  32.5 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  38.81 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.29646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>