33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1276 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1276  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 91 aa  181  3e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1122  CRISPR-associated Cas2 family protein  72.53 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00381279  normal  0.727583 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1141  CRISPR-associated Cas2 family protein  62.64 
 
 		 90 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.210554  hitchhiker  0.00000272687 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0773  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.29 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.294628  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1075  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.94 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1766  CRISPR-associated protein Cas2  37.21 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.12 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  30.68 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2292  CRISPR-associated protein Cas2  41.27 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0734  hypothetical protein  30.12 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0419204  normal  0.160516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0566  CRISPR-associated protein Cas2  36.11 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.527925  normal  0.236066 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1288  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.48 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1871  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.28 
 
 		 84 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0115  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.12 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0035101  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2281  CRISPR-associated protein Cas2  42.31 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.76 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  30 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.41 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3304  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.68 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.63909 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1149  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.18 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  43.4 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5082  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.04 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0577  CRISPR-associated Cas2 family protein  35 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0715298  normal  0.0619602 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  57.14 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15200  CRISPR-associated protein Cas2  42.59 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.33 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  29.79 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  37.7 
 
 		 93 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.77 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  40.74 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.46 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.07 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3579  CRISPR-associated protein Cas2  34.88 
 
 		 92 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>