39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3579 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3579  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 92 aa  190  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.44 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1857  hypothetical protein  44.44 
 
 		 89 aa  86.7  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.224692  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  44.58 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  43.37 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.93 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.37 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.93 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  37.78 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.51 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.06 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  34.09 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1396  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.61 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  32.5 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  32.86 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  34.09 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.14 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  31.82 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 92 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.43 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.65 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  28.74 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  37.65 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  31.46 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  35.71 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.1 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.25 
 
 		 102 aa  44.3  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  29.47 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  31.58 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.31 
 
 		 91 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  34.48 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  29.55 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  23.86 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.47 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0620  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.75 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0662433  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  28.92 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1276  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.88 
 
 		 91 aa  40  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>