32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0620 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0620  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 104 aa  210  4.9999999999999996e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0662433  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2912  CRISPR-associated protein Cas2  42.86 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  37.8 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.62 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  43.08 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.91 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.68 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  34.12 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.06 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  38.6 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  32.31 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  31.88 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1440  CRISPR-associated protein Cas2  36.76 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122416  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  40.26 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  29.76 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  36.11 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.76 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  31.88 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  36.76 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  36.62 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.26 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.76 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  33.85 
 
 		 94 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  28.57 
 
 		 96 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  33.85 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.48 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  35.21 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.33 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.36 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3579  CRISPR-associated protein Cas2  28.75 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.85 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.82 
 
 		 96 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>