47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0178 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 102 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0058  CRISPR-associated Cas2 family protein  54.26 
 
 		 95 aa  117  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  51.06 
 
 		 96 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  38.71 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  33.01 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  37.31 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1440  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122416  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  39.66 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2912  CRISPR-associated protein Cas2  36.76 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.06 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  36.51 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  39.02 
 
 		 99 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.3 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  38.03 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  48.33 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.59 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.83 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0620  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.91 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0662433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.13 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  36.62 
 
 		 97 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.58 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  35.94 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  40.62 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  40.58 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  35.71 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  39.13 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  34.43 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  34.78 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0666  CRISPR-associated protein Cas2  36.14 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3579  CRISPR-associated protein Cas2  37.25 
 
 		 92 aa  44.3  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  48.78 
 
 		 91 aa  42.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.95 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.73 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.23 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0622  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.3 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15209  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  34.78 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.7 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.87 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  32.43 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  36.54 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0225  CRISPR-associated protein Cas2  47.62 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.724313 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  35.94 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  34.25 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  34.78 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>