27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0622 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0622  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 93 aa  193  9e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15209  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  31.25 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2912  CRISPR-associated protein Cas2  32.26 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  31.43 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  31.4 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  26.44 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.23 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  27.78 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  28.07 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  30.34 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.57 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0058  CRISPR-associated Cas2 family protein  26.87 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.3 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  26.44 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  32.22 
 
 		 97 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.65 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  31.25 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  29.73 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.54 
 
 		 96 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  28.72 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  28.72 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  25.29 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.07 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  34.48 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  28.38 
 
 		 99 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  25.76 
 
 		 115 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>