51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4853 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 98 aa  207  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.71 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  38.78 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1440  CRISPR-associated protein Cas2  38.54 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0058  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.04 
 
 		 95 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.78 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2912  CRISPR-associated protein Cas2  37.8 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  48.33 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.75 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  34.38 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  34.92 
 
 		 90 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.38 
 
 		 91 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  42.19 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.5 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0620  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.08 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0662433  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0622  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.43 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15209  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  32.1 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.68 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  39.06 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.66 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.35 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0904  CRISPR-associated protein Cas2  27.84 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216718  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3579  CRISPR-associated protein Cas2  35.71 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  29.89 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.07 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  34.78 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  38.33 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  36.36 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  35.62 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  36.23 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  33.82 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  34.43 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  30.16 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  36.92 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  36.21 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  33.82 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.5 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.77 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  36.92 
 
 		 94 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.16 
 
 		 124 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.18 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  41.82 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.1 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.58 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  32.84 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.71 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  27.17 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>