65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2973 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 92 aa  188  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  68.48 
 
 		 92 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  42.05 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  39.74 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  42.86 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.21 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.16 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  43.75 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  37.66 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.9 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.75 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.66 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  44 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.44 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.35 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.35 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3579  CRISPR-associated protein Cas2  32.5 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  33.7 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  37.63 
 
 		 96 aa  49.7  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  34.57 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.9 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.35 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  36.25 
 
 		 93 aa  48.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  33.68 
 
 		 97 aa  47.4  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.99 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  34.43 
 
 		 93 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1857  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.224692  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  28.72 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.24 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  38.46 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  39.39 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.43 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  29.87 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  30.11 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  25.53 
 
 		 96 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  34.43 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  34.15 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  35.29 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  35.29 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  36.25 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.56 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  37.88 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.27 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.93 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.62 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  35.53 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  29.03 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.29 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.41 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  33.82 
 
 		 109 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  33.8 
 
 		 91 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  34.94 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  37.7 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.15 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  36.99 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  31.33 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  32.18 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0971  hypothetical protein  40.32 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.31 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  31.82 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  24.1 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  28.4 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  32.58 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>