43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1244 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 94 aa  190  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.63 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.08 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.37 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0773  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.96 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.294628  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1981  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.29 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  32.58 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.94 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  32.05 
 
 		 90 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.8 
 
 		 95 aa  52.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.66 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15200  CRISPR-associated protein Cas2  40.79 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 93 aa  50.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  34.41 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  26.37 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.77 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  27.78 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  34.18 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2292  CRISPR-associated protein Cas2  32.94 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  26.37 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  41.18 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  27.85 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.06 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1149  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.5 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.18 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.95 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  29.87 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  31.18 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1122  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.36 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00381279  normal  0.727583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.41 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  30.12 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.05 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  29.17 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1276  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.74 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0115  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.49 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0035101  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1075  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.5 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12830  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000022807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  30.86 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.95 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  27.71 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.88 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0225  CRISPR-associated protein Cas2  53.33 
 
 		 54 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.724313 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>