90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5341 on replicon NC_011880
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 
92 aa  191  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.71 
 
 
93 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.31 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  40.66 
 
 
91 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  49.37 
 
 
90 aa  74.7  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  43.48 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  47.73 
 
 
95 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.57 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  40.96 
 
 
97 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  48.1 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  42.17 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  46.25 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.3 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  40.96 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  39.76 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.16 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.42 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.99 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  36.46 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  40.43 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.68 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  35.42 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.43 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  36.17 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.26 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  40.24 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  36.67 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  35.42 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  40.96 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.75 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  35.42 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  49.35 
 
 
91 aa  60.1  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  48.39 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1634  CRISPR-associated protein Cas2  44.44 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  36.84 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  32.29 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.48 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12830  hypothetical protein  41.18 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000022807  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  41.33 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  34.38 
 
 
96 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.18 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  38.27 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  34.44 
 
 
97 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  39.39 
 
 
93 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  33.68 
 
 
96 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  31.18 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  30.95 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  30.95 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0971  hypothetical protein  49.23 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  39.44 
 
 
96 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  32.56 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  36.71 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0225  CRISPR-associated protein Cas2  61.54 
 
 
54 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.724313 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 
87 aa  50.4  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  33.7 
 
 
92 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  34.41 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  36.9 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.42 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  33.73 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.47 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.33 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  32.1 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1440  CRISPR-associated protein Cas2  34.57 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122416  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0622  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.4 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15209  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.72 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31570  CRISPR-associated protein Cas2  40.3 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0620  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.12 
 
 
104 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0662433  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  32.53 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1981  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.18 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1276  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.4 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1728  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.47 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2912  CRISPR-associated protein Cas2  35 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  32.88 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1141  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.38 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.210554  hitchhiker  0.00000272687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3304  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.89 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.63909 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.05 
 
 
87 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1801  CRISPR-associated protein Cas2  48.65 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0115  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.38 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0035101  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.5 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  31.25 
 
 
87 aa  41.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.94 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.77 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1075  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.81 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  29.49 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0773  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.25 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.294628  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.85 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  35 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>