56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1153 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 124 aa  257  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.82 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  46.38 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.2 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.53 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.3 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  36.17 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.36 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  37.8 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  35.53 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  37.35 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3579  CRISPR-associated protein Cas2  40.51 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.85 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.85 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1857  hypothetical protein  39.24 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.224692  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.58 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  32.94 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  40.62 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.62 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  42.42 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  32.1 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  39.13 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.98 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  35.62 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  31.91 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  30.85 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  35.71 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  32.99 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0225  CRISPR-associated protein Cas2  66.67 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.724313 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0971  hypothetical protein  37.5 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1149  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.92 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12830  hypothetical protein  36.67 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000022807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  35.96 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  36.07 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  28.41 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1801  CRISPR-associated protein Cas2  46.15 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  39.24 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  29.58 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.77 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2912  CRISPR-associated protein Cas2  31.15 
 
 		 96 aa  42  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  35.8 
 
 		 96 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  30.16 
 
 		 98 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  35.56 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.25 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.7 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6021  CRISPR-associated protein Cas2  32.93 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.088486  normal  0.298302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.36 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  37.88 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  29.17 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  28.72 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.62 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  34.85 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5082  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.29 
 
 		 104 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1981  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.43 
 
 		 96 aa  40  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.517558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>