33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5518 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 97 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  48.33 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  38.36 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.53 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.31 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.84 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2912  CRISPR-associated protein Cas2  35.38 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.31 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  34.44 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0058  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.18 
 
 		 95 aa  52.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  37.18 
 
 		 93 aa  52  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1440  CRISPR-associated protein Cas2  40 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  42.59 
 
 		 94 aa  50.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0622  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.25 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.99 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.68 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  39.06 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.38 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  36.54 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  37.68 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0620  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.6 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0662433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.77 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  37.14 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.67 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.07 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  37.68 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  38.33 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0971  hypothetical protein  37.18 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000196536  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  35.53 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  31.94 
 
 		 97 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  31.82 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>