44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2432 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0058  CRISPR-associated Cas2 family protein  55.32 
 
 		 95 aa  120  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  51.06 
 
 		 102 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  42.25 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2912  CRISPR-associated protein Cas2  40.23 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  35.8 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  34.57 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  36.84 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.68 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  36.21 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  35.63 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  32.76 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1440  CRISPR-associated protein Cas2  35.62 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122416  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  38.33 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  32.1 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  38.33 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.38 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.33 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.09 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0971  hypothetical protein  30.99 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000196536  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  28.24 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  30.86 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  26.19 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  38.24 
 
 		 91 aa  44.3  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  35.38 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  33.85 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.82 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.77 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1857  hypothetical protein  32.05 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.224692  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  35 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  26.14 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  26.83 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  39.53 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0622  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.54 
 
 		 93 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15209  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0225  CRISPR-associated protein Cas2  41.46 
 
 		 54 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.724313 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.79 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  31.75 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.53 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  35.09 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  26.14 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.21 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.59 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>