33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1440 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1440  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 97 aa  201  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122416  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  41.05 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2912  CRISPR-associated protein Cas2  39.78 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  38.54 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0058  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.44 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.62 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  40 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  34.57 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.38 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  36.49 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.43 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  38.89 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  32.99 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  34.41 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.4 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  36.14 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0620  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.76 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0662433  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  35.21 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  34.92 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  38.46 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.66 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  35 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  35.21 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  40.3 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  35.16 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.93 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  32.53 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.54 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  32.76 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.13 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>