50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0150 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 95 aa  196  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  47.73 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.93 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  43.82 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.12 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.29 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  40 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.2 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  40.43 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  42.86 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.91 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  40.48 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.62 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  35.42 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.67 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3908  hypothetical protein  41.03 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48914  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  35.48 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  43.24 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  35.11 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1440  CRISPR-associated protein Cas2  34.41 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122416  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  42.86 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  39.74 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  42.86 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  35.42 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2912  CRISPR-associated protein Cas2  34.48 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  41.43 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  35.8 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.54 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  34.02 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  35.48 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.86 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  34.38 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.75 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  38.27 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0971  hypothetical protein  34.44 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.49 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12830  hypothetical protein  33.78 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000022807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.38 
 
 		 96 aa  42  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  35.71 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  37.68 
 
 		 96 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  39.44 
 
 		 96 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  42.86 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0058  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.39 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  31.11 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.89 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1149  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.43 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  38.36 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  42.03 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.03 
 
 		 96 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>