80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2334 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 94 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  65.96 
 
 		 94 aa  140  8e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  70.21 
 
 		 94 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  65.96 
 
 		 94 aa  135  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  45.33 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  45.45 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.25 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.03 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.87 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  41.25 
 
 		 91 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.97 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.46 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.77 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.7 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  36.08 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  36.17 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  35.71 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.24 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  43.75 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.08 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  36.08 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  36.08 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  34.52 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.96 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  46.48 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.51 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  34.52 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  36.05 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  34.52 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  42.25 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  32.99 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.25 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  35.05 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.02 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  34.02 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.93 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  36.11 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2912  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  40.48 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3579  CRISPR-associated protein Cas2  32.86 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  31.17 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12830  hypothetical protein  41.18 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000022807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  34.78 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  32.65 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.96 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  37.84 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0225  CRISPR-associated protein Cas2  48.78 
 
 		 54 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.724313 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  32.99 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.62 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.96 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  42.65 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  29.9 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  36.54 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.52 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.93 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  29.9 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  27.85 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0620  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.31 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0662433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  35.82 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0971  hypothetical protein  34.85 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  34.72 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  37.18 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.71 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  31.34 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0734  hypothetical protein  29.67 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0419204  normal  0.160516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  31.63 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  39.44 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  31.94 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  37.29 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  34.33 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1634  CRISPR-associated protein Cas2  27.08 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  26.8 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  36.92 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1981  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.11 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1448  CRISPR-associated protein Cas2  37.93 
 
 		 87 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.75 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1857  hypothetical protein  33.77 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.224692  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1396  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.99 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  32.84 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>