100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1483 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 96 aa  196  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  77.08 
 
 		 99 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  77.08 
 
 		 99 aa  159  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  71.88 
 
 		 106 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  59.38 
 
 		 96 aa  134  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  58.33 
 
 		 99 aa  131  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  59.38 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  60.42 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  59.38 
 
 		 96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  58.33 
 
 		 96 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  56.25 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  56.25 
 
 		 96 aa  124  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  55.79 
 
 		 95 aa  120  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  56.25 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  56.25 
 
 		 96 aa  117  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  50 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  54.17 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  52.08 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  52.08 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31570  CRISPR-associated protein Cas2  58.33 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1728  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.26 
 
 		 96 aa  104  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  47.42 
 
 		 97 aa  94.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.79 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1634  CRISPR-associated protein Cas2  53.12 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  43.75 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.92 
 
 		 96 aa  89.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2357  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.71 
 
 		 94 aa  87  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  42.71 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  44.68 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  44.68 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  41.49 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  42.17 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  49.48 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  40.48 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3908  hypothetical protein  42.71 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48914  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  35.42 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  37.08 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  34.94 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.62 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  38.89 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.49 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  34.94 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2991  hypothetical protein  55.26 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.27 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  35.05 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.54 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.47 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  37.65 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.94 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.99 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.14 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  40 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.29 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  34.94 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  34.12 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  32.99 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  33.8 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.49 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.73 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.96 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  32.94 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  31.33 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  32.94 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.59 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  32.94 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.71 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  37.14 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.35 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  34.85 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.89 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  40.58 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.46 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.78 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.44 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  29.58 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  35.29 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.68 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.58 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0773  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.7 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.294628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  35.62 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.78 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.11 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  28.87 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  39.39 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  38.18 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.61 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  31.76 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.34 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  32.94 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.12 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.78 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.36 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0666  CRISPR-associated protein Cas2  36.51 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.61 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  25.58 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.82 
 
 		 91 aa  40  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>