37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2357 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2357  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 94 aa  186  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1728  CRISPR-associated Cas2 family protein  84.04 
 
 		 96 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  76.6 
 
 		 96 aa  148  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  56.99 
 
 		 96 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  55.32 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  54.26 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1634  CRISPR-associated protein Cas2  61.7 
 
 		 96 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.74 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  50 
 
 		 96 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  48.94 
 
 		 96 aa  96.7  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  50.54 
 
 		 96 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.87 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  47.87 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  48.28 
 
 		 97 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  46.81 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  47.25 
 
 		 99 aa  92  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  43.62 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  43.62 
 
 		 96 aa  87  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  38.71 
 
 		 96 aa  87  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  39.78 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  40.86 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31570  CRISPR-associated protein Cas2  58.33 
 
 		 95 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.62 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  50 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  39.36 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.41 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  36.17 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  39.36 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  37.23 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  31.18 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.26 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3908  hypothetical protein  43.16 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48914  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  31.88 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  36.84 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  30.77 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2991  hypothetical protein  54.05 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  29.27 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>