91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1073 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  199  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  84.54 
 
 		 96 aa  169  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  52.58 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  53.12 
 
 		 96 aa  110  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  52.08 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  56.63 
 
 		 96 aa  100  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  55.42 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  56.63 
 
 		 96 aa  97.4  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  52.17 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  49.47 
 
 		 99 aa  95.5  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  55.42 
 
 		 96 aa  94.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  50.52 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  47.37 
 
 		 97 aa  94.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  48.42 
 
 		 99 aa  94  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3908  hypothetical protein  56.7 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48914  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  49.48 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  46.88 
 
 		 99 aa  90.1  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  45.83 
 
 		 99 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  50 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  57.73 
 
 		 96 aa  87.8  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.39 
 
 		 96 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  48.28 
 
 		 99 aa  84.7  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  48.19 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.06 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.3 
 
 		 106 aa  83.6  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.3 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  43.75 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  42.27 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1728  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.75 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  42.17 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.11 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  43.3 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1634  CRISPR-associated protein Cas2  47.92 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  42.47 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31570  CRISPR-associated protein Cas2  47.42 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  36.17 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2357  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.84 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.93 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.88 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  34.94 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.42 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  35.38 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.84 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  33.73 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  39.29 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.9 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  36.11 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.4 
 
 		 87 aa  50.4  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.14 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.4 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  35.11 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.91 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.65 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  30.12 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  35.8 
 
 		 94 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  30.12 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  38.03 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  39.44 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  30.95 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.33 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  32.14 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  28.57 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  31.33 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  34.72 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.23 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  31.33 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  26.44 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  25.3 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  38.36 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0618  CRISPR-associated protein Cas2  31.4 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.99 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.49 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0620  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.76 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0662433  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.43 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  28.92 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  29.47 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.53 
 
 		 87 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  25.58 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  30.77 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.14 
 
 		 96 aa  40.8  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.88 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0666  CRISPR-associated protein Cas2  30.99 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  36.59 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.57 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.59 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  27.78 
 
 		 93 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  32.39 
 
 		 98 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0393  CRISPR-associated protein Cas2  30.38 
 
 		 97 aa  40  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0694049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>