52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0393 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0393  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 97 aa  194  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0694049  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0666  CRISPR-associated protein Cas2  79.12 
 
 		 99 aa  149  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0904  CRISPR-associated protein Cas2  54.64 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216718  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  44.19 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  46.51 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.5 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  34.94 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.71 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  35 
 
 		 87 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.71 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.26 
 
 		 87 aa  50.4  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  34.18 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.72 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  37.88 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  35.21 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  36.76 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.85 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.51 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  37.88 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  43.94 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.11 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  32.39 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  34.92 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.29 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.29 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  29.33 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  32.84 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  26.32 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  43.75 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.96 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  37.93 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.88 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.89 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  33.75 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  29.41 
 
 		 97 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1288  CRISPR-associated protein Cas2  29.67 
 
 		 92 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.566019  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  28.57 
 
 		 96 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.62 
 
 		 86 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.03 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  29.73 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  31.75 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  31.75 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.57 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.48 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.17 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.42 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  29.41 
 
 		 87 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  30.16 
 
 		 96 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>