64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1629 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 88 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  53.49 
 
 		 86 aa  97.4  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  55.42 
 
 		 87 aa  95.9  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  52.33 
 
 		 87 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  52.33 
 
 		 87 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  51.81 
 
 		 87 aa  92  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.62 
 
 		 87 aa  88.2  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  48.19 
 
 		 87 aa  87  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  51.81 
 
 		 87 aa  87  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.19 
 
 		 87 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.91 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0618  CRISPR-associated protein Cas2  50 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  51.32 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.35 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  48.19 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.02 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  43.53 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.02 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.53 
 
 		 91 aa  72  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  43.75 
 
 		 87 aa  70.1  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.5 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  45.35 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  44.16 
 
 		 87 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  39.51 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.76 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.05 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1448  CRISPR-associated protein Cas2  38.64 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.57 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  53.95 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.72 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  37.35 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  38.37 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.67 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2839  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.230646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1396  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.51 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.37 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.05 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  37.7 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2002  CRISPR-associated protein Cas2  30.99 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  38.46 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.62 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  29.67 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  31.82 
 
 		 97 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  28.74 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  35.38 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.71 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  30.95 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  30.95 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  32.94 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  38.46 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1424  CRISPR-associated protein Cas2  27.78 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.183922  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0666  CRISPR-associated protein Cas2  38.78 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0393  CRISPR-associated protein Cas2  26.32 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0694049  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1288  CRISPR-associated protein Cas2  28.09 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.566019  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  29.33 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  31.4 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0622  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15209  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  32.35 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  30.56 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  30.88 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1149  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.15 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.17 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>