79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2431 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 
87 aa  174  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  64.71 
 
 
89 aa  94.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  49.43 
 
 
87 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  58.44 
 
 
87 aa  86.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  48.28 
 
 
87 aa  86.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  57.14 
 
 
87 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  55.42 
 
 
87 aa  85.1  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  51.19 
 
 
87 aa  84.7  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  48.75 
 
 
87 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  48.28 
 
 
86 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  53.01 
 
 
87 aa  81.3  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  47.5 
 
 
87 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  42.53 
 
 
87 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  45.98 
 
 
87 aa  77  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.53 
 
 
91 aa  76.6  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  44.87 
 
 
87 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.98 
 
 
86 aa  73.6  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  50.65 
 
 
87 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0618  CRISPR-associated protein Cas2  47.13 
 
 
87 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.67 
 
 
87 aa  71.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  45.35 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  43.75 
 
 
87 aa  70.1  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  50.75 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.75 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.93 
 
 
87 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  42.86 
 
 
87 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.31 
 
 
87 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.08 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.93 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  41.25 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.54 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  47.62 
 
 
87 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  32.61 
 
 
92 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0904  CRISPR-associated protein Cas2  38.27 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216718  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  38.46 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 
88 aa  56.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  33.73 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  44.26 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.03 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  31.17 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  35.37 
 
 
94 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1396  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.48 
 
 
92 aa  51.2  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  38.1 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  31.87 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  34.12 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  34.04 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  34.52 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  35.71 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0393  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0694049  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  32.53 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1448  CRISPR-associated protein Cas2  32.18 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.35 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  31.58 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  32.61 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.9 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.14 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  30.53 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  30.95 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  31.76 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  35.71 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  37.18 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.5 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.53 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.47 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.33 
 
 
95 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 
91 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0666  CRISPR-associated protein Cas2  32.86 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  33.73 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2839  CRISPR-associated protein Cas2  40.43 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.230646  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.71 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  36.99 
 
 
92 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  31.91 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  31.25 
 
 
92 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 
99 aa  41.2  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.38 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  31.88 
 
 
99 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  31.4 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>