78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3930 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 
87 aa  176  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  74.71 
 
 
87 aa  134  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  70.11 
 
 
87 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  68.97 
 
 
87 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  70.11 
 
 
87 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  68.6 
 
 
87 aa  121  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  65.06 
 
 
87 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  66.67 
 
 
87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  64.29 
 
 
87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  60.92 
 
 
86 aa  104  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  57.47 
 
 
87 aa  103  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  55.81 
 
 
87 aa  101  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  55.17 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  53.49 
 
 
87 aa  98.2  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.13 
 
 
87 aa  90.9  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0618  CRISPR-associated protein Cas2  52.87 
 
 
87 aa  87.4  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  48.19 
 
 
88 aa  87  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  50.57 
 
 
87 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  50 
 
 
86 aa  82  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.83 
 
 
87 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  45 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  57.69 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  48.75 
 
 
86 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  45.98 
 
 
87 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  40.23 
 
 
87 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.25 
 
 
87 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  44.19 
 
 
87 aa  73.9  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  50.65 
 
 
87 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  42.53 
 
 
87 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  41.77 
 
 
87 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  42.68 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.71 
 
 
92 aa  67.8  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.23 
 
 
87 aa  67  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  43.18 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.37 
 
 
87 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.56 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  37.93 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1448  CRISPR-associated protein Cas2  42.86 
 
 
87 aa  63.5  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1396  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.46 
 
 
92 aa  62  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1424  CRISPR-associated protein Cas2  40.91 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.183922  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1288  CRISPR-associated protein Cas2  42.05 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.566019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  43.75 
 
 
91 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  41.33 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2002  CRISPR-associated protein Cas2  42.03 
 
 
71 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  36.59 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2839  CRISPR-associated protein Cas2  40 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.230646  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0904  CRISPR-associated protein Cas2  38.55 
 
 
103 aa  54.3  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216718  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  37.88 
 
 
90 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  37.88 
 
 
90 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.62 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.52 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  31.76 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  35.23 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  37.14 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0393  CRISPR-associated protein Cas2  35.21 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0694049  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  34.38 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  36.59 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  34.25 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  47  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  37.14 
 
 
97 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.44 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  34.72 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  39.44 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.03 
 
 
106 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0666  CRISPR-associated protein Cas2  37.14 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  32.94 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  30.43 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  35.21 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  35.71 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3326  CRISPR-associated protein Cas2  31.17 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  39.44 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.65 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.71 
 
 
95 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  30.59 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  30.59 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  33.8 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  33.8 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  31.4 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>