41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3219 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 96 aa  192  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0773  CRISPR-associated Cas2 family protein  67.71 
 
 		 96 aa  136  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.294628  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  66.67 
 
 		 96 aa  133  8e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6021  CRISPR-associated protein Cas2  53.12 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.088486  normal  0.298302 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  53.12 
 
 		 95 aa  107  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15200  CRISPR-associated protein Cas2  52.63 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0115  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.21 
 
 		 96 aa  87.4  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0035101  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1075  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.22 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1288  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.62 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  36.71 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.91 
 
 		 91 aa  48.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.91 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.18 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.91 
 
 		 87 aa  47.8  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  35.71 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2292  CRISPR-associated protein Cas2  28.95 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1276  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.41 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1149  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.36 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  35.06 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1766  CRISPR-associated protein Cas2  29.55 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.82 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  31.65 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  34.18 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.94 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.4 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  32.14 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0734  hypothetical protein  27.5 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0419204  normal  0.160516 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.65 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3304  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.24 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.63909 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.27 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1871  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.88 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.75 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  32.91 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1122  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.41 
 
 		 91 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00381279  normal  0.727583 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.41 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5082  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.88 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  32.61 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  32.61 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.16 
 
 		 92 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2281  CRISPR-associated protein Cas2  37.04 
 
 		 99 aa  40  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>