23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1288 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1288  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1766  CRISPR-associated protein Cas2  61.8 
 
 		 99 aa  120  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5082  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.37 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1871  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.71 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3304  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.23 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.63909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0566  CRISPR-associated protein Cas2  44.83 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.527925  normal  0.236066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6021  CRISPR-associated protein Cas2  38.36 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.088486  normal  0.298302 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1276  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.48 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1075  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.71 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0734  hypothetical protein  32.53 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0419204  normal  0.160516 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.99 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15200  CRISPR-associated protein Cas2  35.62 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.62 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2281  CRISPR-associated protein Cas2  30.61 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.23 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0773  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.99 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.294628  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  39.44 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1122  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.22 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00381279  normal  0.727583 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0162  hypothetical protein  36.51 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1141  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.12 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.210554  hitchhiker  0.00000272687 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2292  CRISPR-associated protein Cas2  33.8 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  33.82 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.1 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>