25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1141 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1141  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 
90 aa  175  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.210554  hitchhiker  0.00000272687 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1122  CRISPR-associated Cas2 family protein  62.64 
 
 
91 aa  122  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00381279  normal  0.727583 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1276  CRISPR-associated Cas2 family protein  62.64 
 
 
91 aa  113  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0577  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.18 
 
 
95 aa  57.8  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0715298  normal  0.0619602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0566  CRISPR-associated protein Cas2  42.65 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.527925  normal  0.236066 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1766  CRISPR-associated protein Cas2  38.46 
 
 
99 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1149  CRISPR-associated Cas2 family protein  40 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399869  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2292  CRISPR-associated protein Cas2  39.68 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5082  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.18 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0734  hypothetical protein  29.27 
 
 
95 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0419204  normal  0.160516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1871  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.92 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1075  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.67 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1145  hypothetical protein  40.79 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0290566 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3304  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.38 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.63909 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  26.97 
 
 
90 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0773  CRISPR-associated Cas2 family protein  28 
 
 
96 aa  43.5  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.294628  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.33 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1288  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.12 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  35.38 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.29646 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2281  CRISPR-associated protein Cas2  38.3 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  26.97 
 
 
91 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15200  CRISPR-associated protein Cas2  40.43 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  29.85 
 
 
90 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12830  hypothetical protein  34.33 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000022807  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>