27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2292 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2292  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 88 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1149  CRISPR-associated Cas2 family protein  63.1 
 
 		 86 aa  120  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399869  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2281  CRISPR-associated protein Cas2  40 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1122  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.03 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00381279  normal  0.727583 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1276  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.27 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15200  CRISPR-associated protein Cas2  30 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  30 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0773  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.89 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.294628  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.95 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1141  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.68 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.210554  hitchhiker  0.00000272687 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1766  CRISPR-associated protein Cas2  36.62 
 
 		 99 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0566  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.527925  normal  0.236066 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1075  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.15 
 
 		 97 aa  48.1  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3304  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.25 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.63909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.66 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  32.94 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.95 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0115  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.86 
 
 		 96 aa  47.4  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0035101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6021  CRISPR-associated protein Cas2  31.17 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.088486  normal  0.298302 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0577  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.5 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0715298  normal  0.0619602 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5082  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.62 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.82 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1871  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.46 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1288  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.8 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  43.64 
 
 		 90 aa  40.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.33 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 		 91 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>