29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15200 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_15200  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 
96 aa  194  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0773  CRISPR-associated Cas2 family protein  52.63 
 
 
96 aa  104  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.294628  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  51.58 
 
 
96 aa  103  6e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  52.63 
 
 
96 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6021  CRISPR-associated protein Cas2  47.37 
 
 
96 aa  99.4  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.088486  normal  0.298302 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  48.86 
 
 
95 aa  92.8  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1075  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.24 
 
 
97 aa  88.2  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0115  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.42 
 
 
96 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0035101  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1149  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.75 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399869  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5082  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.5 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  40.79 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2292  CRISPR-associated protein Cas2  30 
 
 
88 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1288  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.62 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.65 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  32.65 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3304  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.82 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.63909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1871  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.82 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1276  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.59 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1141  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.43 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.210554  hitchhiker  0.00000272687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  32.14 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  36.99 
 
 
90 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_002950  PG1981  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.08 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1122  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.68 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00381279  normal  0.727583 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.33 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  36.25 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0566  CRISPR-associated protein Cas2  25.88 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.527925  normal  0.236066 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  34.18 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2281  CRISPR-associated protein Cas2  27.59 
 
 
99 aa  40  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  34.18 
 
 
87 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>