43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0636 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 95 aa  194  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  61.46 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0773  CRISPR-associated Cas2 family protein  58.33 
 
 		 96 aa  114  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.294628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  53.12 
 
 		 96 aa  107  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6021  CRISPR-associated protein Cas2  45.83 
 
 		 96 aa  96.7  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.088486  normal  0.298302 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15200  CRISPR-associated protein Cas2  48.86 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1075  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.57 
 
 		 97 aa  88.6  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0115  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.71 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0035101  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1766  CRISPR-associated protein Cas2  37.68 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5082  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.65 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1149  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.71 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3304  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.94 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.63909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1871  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.57 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0566  CRISPR-associated protein Cas2  55.32 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.527925  normal  0.236066 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.68 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  35.8 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.97 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2292  CRISPR-associated protein Cas2  32.95 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.9 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2281  CRISPR-associated protein Cas2  33.7 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  35.29 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12830  hypothetical protein  39.39 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000022807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1288  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.23 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1276  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.76 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.93 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.15 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_002950  PG1981  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.82 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1857  hypothetical protein  32.43 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.224692  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1141  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.210554  hitchhiker  0.00000272687 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3579  CRISPR-associated protein Cas2  32.1 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.8 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.05 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1122  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.59 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00381279  normal  0.727583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.8 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  29.27 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  30.38 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  32.93 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0577  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.17 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0715298  normal  0.0619602 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  39.13 
 
 		 109 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.63 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0971  hypothetical protein  36.36 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000196536  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.19 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  27.16 
 
 		 94 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>